GenoMik-Transfer - Anwendungsorientierte Genomforschung an Mikroorganismen
 
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ProkaGENOMICS 2015
Neue Broschüre: Facetten der Genomforschung
Wissenschaftler entschlüsseln die Baupläne des Lebens (pdf; 12,3 Mb)
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Verbundprojekt: PathControl / Beschreibung Teilprojekt
 
Teilprojekt 2: Einfluss von Bacillus amyloliquefaciens auf die mikrobielle Gemeinschaft der Rhizoplane und auf die Genexpression des pflanzenpathogenen Pilzes Rhizoctonia solani
Laufzeit: 01.01.10-30.06.13
Projektleiter:
   Prof. Dr. Alfred Pühler, Universität Bielefeld
   Dr. Andreas Schlüter, Universität Bielefeld

In diesem Projekt soll die Wechselwirkungen zwischen dem Biokontroll-Stamm Bacillus amyloliquefaciens FZB42 und dem phytopathogenen Pilz Rhizoctonia solani im Wurzelraum der Modell-Pflanze Lactuca sativa (Salat) untersucht werden. Um eine Analyse auf molekularer Ebene zu ermöglichen, ist es zunächst erforderlich, die Genomsequenz des pathogenen Pilzes Rhizoctonia solani (Anastomose-Gruppe AG1-IB) zu ermitteln. Ein R. solani Microarray, der Pathogenitäts- und Virulenzdeterminanten sowie Gene, die für das Pilzwachstum und die Infektion wichtig sind, repräsentiert, wird für die Analyse des R. solani Transkriptionsprofils in Abhängigkeit der Anwesenheit des Biokontroll-Stamms B. amyloliquefaciens FZB42 eingesetzt.
Ebenso soll der Einfluss von R. solani auf die Transkription von B. amyloliquefaciens FZB42 Genen untersucht werden. Hierfür steht ein bereits erprobter B. amyloliquefaciens Microarray zur Verfügung. Mit Hilfe dieser Untersuchungen sollen genetische Determinanten identifiziert werden, die für die Biokontroll-Eigenschaften des Stammes FZB42 gegen den Pilz R. solani von Bedeutung sind. Andererseits wird erwartet, dass die Analyse des R. solani Transkriptionsprofils in Abhängigkeit des Antagonisten B. amyloliquefaciens FZB42 Einblicke in R. solani Virulenzeigenschaften gewährt. Des Weiteren wird der Einfluss des Biokontroll-Stammes FZB4 auf die Struktur der mikrobiellen Gemeinschaft in der L. sativa Rhizospäre mit Hilfe eines Metagenomansatzes analysiert.